Подойдут, только лучше их, всё равно, застелить фольгой, что бы можно вытащить было потом (или пищевой пленкой, которая выдерживает нагрев до 100С - обычно для микроволновок такая продается).
Только время приготовления должно чуток по-меньше тогда быть - всё-таки, силикон быстрее нагревается, чем керамические формочки.